生物統計学


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講義とRによる実習を織り交ぜた実践的授業.授業中に解く「演習問題」と授業1週間後までに回答する「小テスト」がある.
先生は反転授業をしたいそうだ.反転授業とは知識を予習し授業では演習をする,講義+宿題という従来型の授業とは逆の形態を持つ授業のこと.そのため講義資料は土日までに配布される.
資料はITC-LMSにアップロードされる.

曜限・場所

木曜1限
情報基盤センター

教員

岸野洋久(きしの ひろひさ)
 生物測定学研究室 教授

成績

項目 点数
演習問題 2 * 11
小テスト 3 + 2 * 11
レポート 20 * 2
期末試験 13

期末試験

日時 1月15日08:40-10:10 あと 日
場所 いつもの場所

教科書・参考書

なし

参考サイト

R

Rの情報
RjpWiki
Rの日本語Wiki.分からないことがあればここをあたるもよし,Helpを開くもよし.インストールのときだけじゃなく学習時も役に立つ.管理者の岡田昌史氏はRの普及活動をしている.

統計資料

データは共有の財産
政府統計
通信利用動向調査,社会生活基本調査,体力・運動能力調査,人口動態調査等 各省庁の統計資料
気象庁 ホーム > 各種データ・資料
日本の気象データ
NOAA Climate.gov Home > Maps & Data
海外の気象データ
FAOSTAT
食料・農業のデータ 2014年10月23日から旧バージョンは更新されない.この学部にいたら1日に3回は世話になるであろうデータベース.
日本野球機構 公式戦成績
プロ野球のデータ,これは2014年度のもの.
MLB Home > Stats
メジャーリーグのデータ

助言

授業

授業でやったことのログをとっておくと後で役立つかもしれない.「ファイル > 新規文書」で作成する.

PDFの悩み

統計資料をPDFで公開する団体がある.表をスプレッドーシート(Microsoft Excel, LibreOffice Calc, etc)に貼付けたいのにうまく選択できないというときは, Altキーを押しながら 矩形選択を試みるとよい.コピーしてそのまま貼付けるとほとんど望み通りの結果が得られる.
データが複数列にわたる場合には,そのまま貼付けるとスペース" "で区切られて1行が同じセルに納められることがある.そんなときは一旦メモ帳やテキストエディットに貼付ける.それから数字の桁区切りに使われるカンマ","を注意深く取り除き,スペースをカンマに置換する.この作業が終わったら文書の拡張子を"csv"として保存し,スプレッドシートで読み込む.
これでも解決しないようであれば,該当する団体に連絡してODSやXLSX(XLS)形式でデータを提供してもらう.

期末試験

演習問題と小テストができれば問題ない,イージーミスには気をつけて.

01 要約統計量

02 クラスター分析

03 主成分分析(PCA)

04 ランダムサンプリング

05 推定と検定

06 分散分析(ANOVA)

07 回帰分析

08 一般化線形モデル(1)

09 カイ二乗検定

10 一般化線形モデル(2)

関数lmer, glmerを使うにはライブラリlmer4が必要だが,実はRcpp, minqa, nloptrも必要.

11 予測とモデル選択

STEP BY STEP

12 最尤法と統計的モデリング

13 期末試験

コメント

  • Windowsで入力したチルダ"~"がMacでオーバーライン"‾"になってた. -- (2014-12-16 17:14:44)
  • ITC-LMSは理学部のとある界隈で批判されているらしい. -- 名無しさん (2014-12-31 04:00:59)
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